污染水體的生物種類很多，主要有病毒、細菌、寄生蟲等。病毒主要包括有脊髓灰質炎病毒、柯薩基病毒和肝炎病毒等。這些病毒一般存在于病人腸道，通過糞便污染水體，然后再危害人體。細菌是污染水體的主要污染物，它包括腸道細菌（大腸菌群、結核桿菌等）和病原菌（沙門氏菌、霍亂孤菌、結核菌等），這些細菌可導致人體患各種急性傳染病，如傷寒、霍亂等疾病以及腸道疾病。寄生蟲主要包括溶組織阿米巴、麥地那線蟲、蘭伯氏賈弟蟲、血吸蟲以及腸道的鉤蟲、蛔蟲、鞭蟲、姜片蟲、蟯蟲、豬條絳蟲、牛肉緣蟲、矩膜殼絳蟲、細粒棘狀線蟲等，它們通過動物、病人或病人的糞便污染水體，再通過污染水體、土壤等途徑傳播至人體。

人類食用被污染的水中生物引起疾病的事例已經多次發生。1988年上海市因人們食用污染水域中生長的毛蚶，甲肝流行，使數以十萬計的人因染疾而停工停產。因此，人們不能食用被污染水域中的水生動植物，這些生物內含有有毒物質，人食后在體內積儲起來，達到一定的程度就引起疾病。在食用前，如果弄不清是否被污染，可以嗅一下是否有異味，看一下這些生物體表是否光滑，有無異物生長，發現有問題就不要吃了。有時煮熟后，吃時發現有“油漆”味，應停止食用。